根據(jù)分離原理不同，電泳可分為區(qū)帶電泳、移界電泳、等速電泳和聚焦電泳。根據(jù)電泳是在溶液中還是在固體支持物上進(jìn)行，分為自由電泳和支持物電泳。
　　移動(dòng)界面電泳
　　是將被分離的離子（如陰離子）
　　混合物置于電泳槽的一端（如負(fù)極），在電泳開始前，樣品與載體電解質(zhì)有清晰的界面。電泳開始后，帶電粒子向另一極（正極）移動(dòng)，泳動(dòng)速度最快的離子走在最前面，其他離子依電極速度快慢順序排列，形成不同的區(qū)帶。只有第一個(gè)區(qū)帶的界面是清晰的，達(dá)到完全分離，其中含有電泳速度最快的離子，其他大部分區(qū)帶重疊。
　　區(qū)帶電泳
　　是在一定的支持物上，于均一的載體電解質(zhì)中，將樣品加在中部位置，在電場作用下，樣品中帶正或負(fù)電荷的離子分別向負(fù)或正極以不同速度移動(dòng)，分離成一個(gè)個(gè)彼此隔開的區(qū)帶。區(qū)帶電泳按支持物的物理性狀不同，又可分為紙和其他纖維膜電泳、粉末電泳、凝膠電泳與絲線電泳。
　　等電聚焦電泳
　　是將兩性電解質(zhì)加入盛有pH梯度緩沖液的電泳槽中，當(dāng)其處在低于其本身等電點(diǎn)的環(huán)境中則帶正電荷，向負(fù)極移動(dòng)；若其處在高于其本身等電點(diǎn)的環(huán)境中，則帶負(fù)電向正極移動(dòng)。當(dāng)泳動(dòng)到其自身特有的等電點(diǎn)時(shí)，其凈電荷為零，泳動(dòng)速度下降到零，具有不同等電點(diǎn)的物質(zhì)最后聚焦在各自等電點(diǎn)位置，形成一個(gè)個(gè)清晰的區(qū)帶，分辨率極高。
　　等速電泳
　　是在樣品中加有領(lǐng)先離子（其遷移率比所有被分離離子的大）和終末離子（其遷移率比所有被分離離子的小），樣品加在領(lǐng)先離子和終末離子之間，在外電場作用下，各離子進(jìn)行移動(dòng)，經(jīng)過一段時(shí)間電泳后，達(dá)到完全分離。被分離的各離子的區(qū)帶按遷移率大小依序排列在領(lǐng)先離子與終末離子的區(qū)帶之間。由于沒有加入適當(dāng)?shù)闹С蛛娊赓|(zhì)來載帶電流，所得到的區(qū)帶是相互連接的，且因“自身校正”效應(yīng)，界面是清晰的，這是與區(qū)帶電泳不同之處。